25 Maart 2013 — De eerste multi-gene DNA sequencing test die kan helpen voorspellen kankerpatiënten reacties op behandeling is gegaan in de National Health Service (NHS), dankzij een partnerschap tussen wetenschappers aan de Universiteit van Oxford en Oxford University ziekenhuizen NHS Trust.
De test gebruikt de nieuwste technieken van DNA sequencing te detecteren mutaties in 46 genen die groei van kanker bij patiënten met solide tumoren kunnen rijden. De aanwezigheid van een mutatie van een gen kan potentieel Bepaal welke behandeling een patiënt moet ontvangen.
De onderzoekers zeggen het aantal genen getest merken een stap verandering in de invoering van volgende-generatie DNA sequencing-technologie in de NHS en kondigt de komst van genomic geneeskunde met hele genoom sequentiebepaling van patiënten net om de hoek.
De veel-gen sequencing test is gelanceerd door het Nationaal Instituut voor gezondheid onderzoek (NIHR) Oxford biomedisch onderzoek centrum (BRC), een samenwerking tussen Oxford University ziekenhuizen NHS Trust en Oxford University te versnellen van innovatie van de gezondheidszorg, en die heeft deel-gefinancierd dit initiatief.
Het BRC-centrum voor moleculaire diagnostiek voert de test. Het lab, gebaseerd op Oxford universitaire ziekenhuizen, heeft betrekking op alle kankerpatiënten in de Thames Valley gebied. Maar de wetenschappers zijn op zoek naar dit opschalen in een echt nationaal NHS-service door de loop van dit jaar.
De nieuwe 300 pond test bespaart aanzienlijk meer in drug kosten door het verkrijgen van patiënten op de juiste behandelingen meteen, verminderen van schadelijke gevolgen van bijwerkingen, alsmede de tijd verloren alvorens een effectieve behandeling.
'Wij zijn de eerste om een multi-gene diagnostische test voor tumor profileren op de NHS met behulp van de nieuwste technologie van DNA sequencing,' zegt Dr Jenny Taylor van de Wellcome Trust centrum voor menselijke genetica aan de Universiteit van Oxford, die is programmadirecteur Genomic geneeskunde aan het BRC NIHR Oxford en was betrokken bij het werk. ' Het is een belangrijke stap verandering in de manier waarop we dingen doen. Deze nieuwe 46 gene test beweegt ons uit de buurt van conventionele methoden voor het rangschikken van enkele genen, en een enorme stap op weg naar meer uitgebreide genoom sequencing in beide infrastructuur en bij de behandeling van de geproduceerde gegevens.'
Dr. Anna Schuh, die aan het hoofd van het BRC-centrum voor moleculaire diagnostiek en is een consultant hematoloog op Oxford universitaire ziekenhuizen, voegt toe: ' patiënten graag het idee van een test die kan voorspellen en zeggen aan de voorkant of zij op een anders giftige behandeling reageren zal. Wat de patiënt ziet is niet anders dan aanwezig. Een biopsie is ontleend aan de patiënt tumor voor genetische tests met een consultant praten via de resultaten een paar dagen later. Het is onderdeel van het normale proces van diagnostische.'
Kanker is vaak beschreven als een genetische ziekte, aangezien de overgang die een cel doorloopt in kanker steeds de neiging te worden gedreven door wijzigingen aan DNA van de cel. En in toenemende mate afhankelijk van nieuwe kanker geneesmiddelen te weten of een mutatie in een enkel gen aanwezig in een patiënt kankercellen is.
Bijvoorbeeld, kan een Long kankerpatiënt een biopsie genomen om te controleren op wijzigingen in het EGFR gen hebben. Als er een mutatie, kan de patiënt vervolgens worden behandeld met een medicijn dat als een EGFR-remmer werkt. Als er geen mutatie, dergelijke drugs zal niet werken en de patiënt zou krijgen een ander geneesmiddel dat zou effectiever zijn voor hen. Weten de aanwezigheid of afwezigheid van mutaties in een bepaalde gen kunt kiezen het pad behandeling voor die patiënt.
De NHS kunt momenteel testen voor mutaties in 2 of 3 genen--genen genaamd BRAF, EGFR of KRAS--met behulp van oudere sequencing-technologie die is geweest rond voor decennia. Inspanningen worden ondernomen om te kijken naar het aantal kankergenen sequenced tot negen als standaard.
De wetenschappers van Oxford zijn de eerste dergelijke multi-gene tests in de NHS met behulp van de nieuwste technieken van DNA sequencing mogelijk maken. De NHS dienst die zij hebben gelanceerd ziet er voor mutaties in 46 genen, en ze nu werken aan controle van het gebruik van een test met betrekking tot 150 gen.
Een diagnostische test of 'panel' die voor mutaties in meerdere genen tegelijk kan beschermen is belangrijk voor de toegang tot alle nieuwe kanker drugs die langs komen.
'Het is zeer moeilijk te beheren in de diagnostische laboratoria NHS zonder gene panelen,' verklaart Dr Schuh. ' Momenteel nieuwe kanker geneesmiddelen hebben de neiging om goedgekeurd naast een diagnostische test die specifiek zijn voor die drug die kan bepalen welke patiënten in aanmerking komen. Maar als meer en meer drugs als deze kom langs, we eventueel kan niet lopen dat de vele verschillende afzonderlijke proeven die dit zou kunnen betekenen. We hebben behoefte aan een test voor een scala van drugs.'
Dr. Taylor voegt toe: ' We wilden een test die de nieuwste technieken van DNA sequencing gebruiken zou voor het detecteren van een breed scala van mutaties in een breed scala van genen. Een test die zou kunnen betrekking hebben op meer kankers en meer behandelingen, allen voor een vergelijkbare kosten voor conventionele methodes.'
De test wordt uitgevoerd op een volgende generatie sequencing platform van leven Technologies Corporation, genaamd Ion persoonlijke genoom Machine (PGM(TM)). De test en de bijbehorende software zijn aanzienlijk gewijzigd zoals gevraagd door het team van Oxford aan diagnosenormen in hun lab.
Dit werk werd medegefinancierd door de Technology Strategy Board, de Britse innovatie Agentschap, door middel van een subsidie aan de NIHR Oxford BRC, leven Technologies Corporation, AstraZeneca, en Janssen Research & Development, LLC, een van de Janssen farmaceutische bedrijven.
Als onderdeel van de ontwikkeling van de test, het Oxford team keek ter verbetering van de voorbereiding van het oorspronkelijke monster in het lab, en om de software en infrastructuur te ondersteunen om te verwerken en analyseren van de hoeveelheid informatie betrokken. Belangrijker nog, heeft de Oxford-groep uitgevoerd tests en vergelijkingen om te controleren of de robuustheid van de techniek met kanker biopsieën rechtstreeks van patiënten.
Het team ten opzichte van de nieuwe test van 46 gen tegen conventionele technieken voor 80 opeenvolgende kanker biopsieën in het ziekenhuis lab werkstroom.
De volgende generatie DNA sequencing methode ontdekt de mutaties die de conventionele methode heeft; op speurder nieuwe mutaties niet de conventionele methode; en gedetecteerde mutaties presenteren bij veel lagere niveaus in de monsters. De tijd die nodig is voor de test 46 gene tevens voorzien in de standaard levertermijn voor monsters in het lab.
Er is duidelijke voordeel bij bevolkingsonderzoek enkele van de 46 genen opgenomen in de test; Er is waarschijnlijk of waarschijnlijk klinische voordeel bij bevolkingsonderzoek sommige van de andere; mutaties in verdere genen misschien wel belangrijk in sommige vormen van kanker, maar niet anderen; en de andere genen, we nog niet weten. Maar hebben deze informatie betekent onderzoekers kan onderzoeken of een mutatie biologische betekenis heeft.
'We kunnen houden van gegevens, het bank en koppelen aan de geanonimiseerde klinische gegevens over patiënten kankers voor toekomstig onderzoek,' verklaart Dr Schuh.
De test wordt gezocht naar mutaties in 'hotspot' regio's van elk gen--gebieden waar mutaties eerder optreden. Dit betekent dat de test mag missen tot 5% van mutaties, zoals ze elders kunnen optreden, maar dit nog steeds aanzienlijk beter dan de 'valse negatief is' met behulp van de huidige methoden.
Het kan ook detecteren mutaties aanwezig in slechts 5% van de tumorcellen aanwezig in een monster. Dit is veel lager dan momenteel mogelijk is, en belangrijk is in de mogelijkheid om informatie uit cellen aanwezig in alleen de kleine getallen in een tumor te vangen, maar die zijn nog steeds belangrijk in kanker groei bewerkstelligen.
Hebben aangetoond dat het mogelijk is om in te voeren de test 46 gen als een service NHS, gaan de onderzoekers nu op om te onderzoeken van het potentieel van een test die zal volgnummer 150 genen. Het team zal gebruiken de test allereerst met 500 bestaande monsters van patiënten die deelnemen aan kanker klinische proeven te kunnen de resultaten achteraf met informatie van de proeven te vergelijken. Zij zullen dan de test met 1000 nieuwe kanker biopsieën gebruiken om beter te begrijpen hoe de extra informatie kan worden gebruikt in de begeleiding van behandelingen voor patiënten en hun resultaten.
Dr Schuh zegt: ' "Panel" proeven moeten aanzienlijk potentieel terwijl we op de kosten wachten van sequencing hele patiënt genomen om te komen naar beneden. Zelfs dan kan deelvenster onderzoek worden bij ons voor enige tijd. Nadat de hele genoom sequencing komt in gebruik, is het mogelijk dat deelvenster proeven met patiënten biopsieën, met alleen die waarvan deelvenster test toont geen resultaat hebben hun hele DNA sequenced om te zoeken naar zeldzamer genetische veranderingen eerst worden gebruikt.'
Lord Howe, Minister van volksgezondheid, zei: ' wij willen worden onder de beste landen in de wereld bij de behandeling van kanker en weten dat beter op maat zorg voor patiënten potentieel kan levens redden.
' Gezondheid onderzoek als dit is ongelooflijk belangrijk en ik ben blij dat we kunnen steunen het werk van onderzoekers in Oxford door het Nationaal Instituut voor gezondheid onderzoek Biomedical Research Centre.
'Door te snel vertalen bevindingen van genetica onderzoek naar echte voordelen voor patiënten, hun werk zal ervoor dat patiënten meteen de juiste behandelingen krijgen, potentiële bijwerkingen verminderen en ook helpen ons NHS middelen efficiënter gebruiken.'
Het deelvenster 46-gen is gebaseerd op Ion AmpliSeq(TM) chemie van leven Technologies Corporation. De test vereist een zeer kleine hoeveelheid DNA (5 nanogram), een voordeel bij het werken met klinische monsters die meestal in aantal beperkt zijn.
De Ion persoonlijke genoom Machine (PGM(TM) en Ion AmpliSeq(TM) zijn voor onderzoek gebruiken alleen, niet bestemd voor gebruik in diagnostische procedures. Leven technologieën wil voortzetten CE-IVD aanwijzing voor de PGM.
Opmerking: Materialen kunnen worden bewerkt voor inhoud en lengte. Voor meer informatie, neem contact op met de bron aangehaald.
Ontkenning: Dit artikel is niet bedoeld om medisch advies, diagnose of behandeling. Standpunten hier weerspiegelen niet noodzakelijk die van Science Daily of haar personeel.
More Info: Loopband gesprekken: die paren betogen meer?
No comments:
Post a Comment